La Commission Locale de l'Eau ou CLE est l'organe décisionnel chargé de rédiger et de définir les objectifs du Schéma d'Aménagement et de Gestion des Eaux (SAGE) du bassin versant de la Vie et du Jaunay.
C'est une assemblée uniquement délibérante.
Elle est composée de 38 membres répartis en trois collèges, celui des élus et des collectivités locales, le collège des usagers et associations et enfin celui des services de l'Etat et des établissements publics.

La Commission Locale de l'Eau renouvellée en novembre 2008
La CLE organise et gère l'ensemble de la procédure d'élaboration, de consultation puis de mise en œuvre du SAGE.
Par ailleurs, elle constitue un lieu privilégié de concertation, de débat, de mobilisation et de prise de décision. Elle veille notamment à ce que les problématiques identifiées dans l'étape d'état des lieux et dans le diagnostic du bassin versant, soient intégrées dans le SAGE. A titre d'exemple, si le diagnostic met en avant un problème de qualité d'eau sur le bassin versant, le SAGE doit avoir parmi ces objectifs l'amélioration de la qualité de la ressource en eau.
La CLE a donc pour mission l'élaboration du SAGE à travers un travail de consultation des différents acteurs du territoire sur les problématiques de la gestion de l'eau et des milieux aquatiques. Elle veille à la mise en œuvre, au suivi des objectifs du SAGE et à la communication sur l'évolution de la ressource.
Mise en place en 2002 par arrêté du Préfet de la Vendée, la CLE a été renouvellée en 2008. Son Président est M. Jean-Claude MERCERON, sénateur de la Vendée et Président du Syndicat Mixte des Marais de la Vie, du Ligneron et du Jaunay, la structure porteuse du SAGE.

M. Jean-Claude MERCERON, Président de la CLE,
Président du Syndicat Mixte des Marais de la Vie, du Ligneron et du Jaunay
Pour faciliter son fonctionnement, elle s'appuie sur les travaux d'un bureau et a mis en place divers groupes de travail.